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LAN toolbox

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Laboratory of Analysis in Neurosciences (LAN) is a Matlab toolbox for neuroscientist data (EEG and reaction time for the time being).The aim of this proyect is to create a shared lenguage among differents algorithms and softwares in the field (e.g. Fieldtrip, Eeglab, Chronux, Brainstorm, etc), in order to facilitate the implementation of experimental analysis by the users.

The project is still in development phase.

In the current version seven different modules have been implemented:

1. The first (basic module) includes essential system functions.

2. The segmetation module includes tools to import data and segmentation.

3. The preprocessing module detects gross artifacts and interpolates channels. It has a GUI for visual exploration.

4. ERP module includes non-parametric stattistics, cluster-based permuation, and a GUI to explore the data.

5. Time-frequency module includes all classics time-frequency methods (Fouier windows, Hilberts, Multi-taper, Wavelets), non-parametric statistic, and a GUI to explore the data.

6. Netwok module includes basic functions of synchrony and network analysis (in developing)

7. The statistical module includes the basic functions used in ERP and frequency analysis.

8. Finally, the module of models and reaction-time is being implemented to performe more complex analysis between behavioral and electrophisiological data (this module requires R software )

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LAN toolbox


Laboratorio de Análisis en Neurociencia es un toolbox (para Matlab) para el análisis de datos neurocientíficos (EEG y tiempos de reacción por el momento), cuyo propósito es establecer un lenguaje común entre procedimientos y algoritmos de otros softwares del área (como Fieldtrip, Eeglab, Chronux, Brainstorm, etc) que posibilite el desarrollo de análisis experimentales para el usuario medio del área.

El proyecto aun se encuentra en fase de prueba.

En la versión actual se han implementado siete módulos diferentes.

El primer módulo (Módulo básico) incluye funciones esenciales del sistema.

El módulo de segmentación incluye herramientas de importación de datos y segmentación.

El módulo de pre-procesamiento incluye funciones para realizar detección de artefactos, interpola canales y una visualización (GUI) de datos segmentados.

El módulo de ERP, incluye estadística no-paramétrica y corrección basada clusters.

El modulo de tiempo-frecuencia, incluye varios métodos de análisis (Fourier por ventanas, Hilberts y la implementación de Fieldtrip para multitaper y wavelet), estadística no paramétrica y una interfaz gráfica para la exploración de los resultados.En proceso de implementación están los análisis de fase y sincronía.

El modulo de estadística, incluye las funciones básicas usadas en el modulo ERP y tiempo-frecuencias.

Por ultimo el modulo de modelos y tiempos de reacción esta en fase de implementación para realización de análisis más complejos entre los datos conductuales y electroficiológicos (incluye hasta el momento realización de modelos mixtos usando R ).